svētdiena, 2010. gada 21. marts

skaties stereo!

Pēdējā laikā darbā galvenokārt nodarbojos ar zinātnisko publikāciju rakstīšanu par manis veikto dažādu proteīnu telpisko (3D) struktūru noteikšanu. Vienkārši runājot, proteīni ir mašīnas, kas veic/piedalās gadrīz visos procesos organismā (ķīmiskos, mehāniskos u.c.). To bioloģisko funkciju nosaka to veidojošo aminoskābju izkārtošanās telpā, tādējādi, ka noteikti atomi var mijiedarboties ar citiem atomiem no proteīna substrāta vai citām molekulām. Bieži to dēvē par slēdzenes (proteīns) - atslēgas (substrāts) principu. Šo pašu modeli izmanto arī zāļu dizainā, mēģinot atrast "atslēgu", kas nobloķē "slēdzeni" tā, ka piem. dabiskais substrāts vairs iekšā netiek. Protams, ka slēdzenes telpiskā struktūra ļoti palīdz šajā procesā. Zinātniskajās publikācijās šīs proteīnu struktūras cenšas attēlot kā telpiskus objektus izmantojot t.s. stereo-skatu, kas ir balstīts uz līdzīgiem principiem kā magic eye, kur 2D zīmējumā parasti ir paslēpts telpisks objekts. Tad nu es pēdējā laikā diezgan daudz trenējos redzēt šīs struktūras telpiski, kas manuprāt ir nedaudz grūtāk nekā magic eye zīmējumi, bet nu jau esmu labi piešāvies. Zemāk ir proteīna NP_247299.1 no mikroorganisma Methanococcus jannaschii struktūra, kura funcija nav zināma. Pamēģini arī tu redzēt to telpiski! (telpiskā bilde būs redzama pa vidu, fokusējot acis tālumā).

Nav komentāru: